Python Module Index

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c
mdt.cli_scripts
    mdt.cli_scripts.MDT
    mdt.cli_scripts.mdt_apply_mask
    mdt.cli_scripts.mdt_batch_fit
    mdt.cli_scripts.mdt_create_bvec_bval
    mdt.cli_scripts.mdt_create_mask
    mdt.cli_scripts.mdt_create_protocol
    mdt.cli_scripts.mdt_create_roi_slice
    mdt.cli_scripts.mdt_estimate_noise_std
    mdt.cli_scripts.mdt_get_example_data
    mdt.cli_scripts.mdt_gui
    mdt.cli_scripts.mdt_info_img
    mdt.cli_scripts.mdt_info_protocol
    mdt.cli_scripts.mdt_init_user_settings
    mdt.cli_scripts.mdt_list_devices
    mdt.cli_scripts.mdt_list_models
    mdt.cli_scripts.mdt_math_img
    mdt.cli_scripts.mdt_math_protocol
    mdt.cli_scripts.mdt_model_fit
    mdt.cli_scripts.mdt_view_maps
    mdt.cli_scripts.mdt_volume_merge
mdt.component_templates
    mdt.component_templates.base
    mdt.component_templates.batch_profiles
    mdt.component_templates.compartment_models
    mdt.component_templates.composite_models
    mdt.component_templates.library_functions
    mdt.component_templates.parameters
    mdt.component_templates.utils
mdt.configuration
 
g
mdt.gui
    mdt.gui.maps_visualizer
    mdt.gui.maps_visualizer.actions
    mdt.gui.maps_visualizer.base
    mdt.gui.maps_visualizer.config_tabs
    mdt.gui.maps_visualizer.config_tabs.tab_general
    mdt.gui.maps_visualizer.config_tabs.tab_map_specific
    mdt.gui.maps_visualizer.config_tabs.tab_textual
    mdt.gui.maps_visualizer.design
    mdt.gui.maps_visualizer.design.main_rc
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_MainWindow
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_MapSpecificOptions
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_save_image_dialog
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_TabGeneral
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_TabMapSpecific
    mdt.gui.maps_visualizer.design.ui_TabTextual
    mdt.gui.maps_visualizer.main
    mdt.gui.maps_visualizer.renderers
    mdt.gui.maps_visualizer.renderers.base
    mdt.gui.maps_visualizer.renderers.matplotlib_renderer
    mdt.gui.maps_visualizer.widgets
    mdt.gui.model_fit
    mdt.gui.model_fit.design
    mdt.gui.model_fit.design.main_gui_rc
    mdt.gui.model_fit.design.ui_about_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_dialog_get_example_data
    mdt.gui.model_fit.design.ui_fit_model_tab
    mdt.gui.model_fit.design.ui_generate_brain_mask_tab
    mdt.gui.model_fit.design.ui_generate_protocol_load_gb_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_generate_protocol_tab
    mdt.gui.model_fit.design.ui_generate_protocol_update_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_generate_roi_mask_tab
    mdt.gui.model_fit.design.ui_main_gui
    mdt.gui.model_fit.design.ui_optimization_extra_data_add_protocol_map_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_optimization_extra_data_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_optimization_options_dialog
    mdt.gui.model_fit.design.ui_runtime_settings_dialog
    mdt.gui.model_fit.qt_main
    mdt.gui.model_fit.tabs
    mdt.gui.model_fit.tabs.fit_model_tab
    mdt.gui.model_fit.tabs.generate_brain_mask_tab
    mdt.gui.model_fit.tabs.generate_protocol_tab
    mdt.gui.model_fit.tabs.generate_roi_mask_tab
    mdt.gui.model_fit.utils
    mdt.gui.utils
    mdt.gui.widgets
    mdt.gui.widgets.composite_widgets
    mdt.gui.widgets.decorator_widgets
    mdt.gui.widgets.design
    mdt.gui.widgets.design.ui_scientific_number_scroller_widget
 
l
mdt.lib
    mdt.lib.batch_utils
    mdt.lib.components
    mdt.lib.deferred_mappings
    mdt.lib.exceptions
    mdt.lib.file_conversions
    mdt.lib.file_conversions.npy
    mdt.lib.fsl_sampling_routine
    mdt.lib.log_handlers
    mdt.lib.masking
    mdt.lib.nifti
    mdt.lib.post_processing
    mdt.lib.shell_utils
    mdt.lib.sorting
 
m
mdt
mdt.model_building
    mdt.model_building.likelihood_functions
    mdt.model_building.model_functions
    mdt.model_building.parameter_functions
    mdt.model_building.parameter_functions.dependencies
    mdt.model_building.parameter_functions.numdiff_info
    mdt.model_building.parameter_functions.priors
    mdt.model_building.parameter_functions.transformations
    mdt.model_building.parameters
    mdt.model_building.signal_noise_models
    mdt.model_building.trees
    mdt.model_building.utils
mdt.models
    mdt.models.base
    mdt.models.compartments
    mdt.models.composite
 
p
mdt.protocols
 
s
mdt.simulations
 
u
mdt.utils
 
v
mdt.visualization
    mdt.visualization.dict_conversion
    mdt.visualization.layouts
    mdt.visualization.maps
    mdt.visualization.maps.base
    mdt.visualization.maps.matplotlib_renderer
    mdt.visualization.maps.utils
    mdt.visualization.samples
    mdt.visualization.utils